Na niebiesko-czerwonym tle znajduje się złote strzemię oraz jedenaście symetrycznie rozmieszczonych złotych gwiazd sześcioramiennych.

Złote strzemię oraz niebiesko-czerwone barwy nawiązują do herbu rodowego Brzostowskich - dawnych właścicieli Czarnożył. Adam Brzostowski (1722-1790) - czołowy przedstawiciel tego rodu wstawił się jako pionier postępu rolniczego na Ziemi Wieluńskiej i w całej ówczesnej Rzeczpospolitej. Stosował nowatorskie metody uprawy roli, siewu i hodowli zwierząt. Wprowadził obowiązek nauczania dzieci wiejskich. Nawiązanie do tradycji rodu Brzostowskich upamiętnia ich zasługi gospodarcze i obywatelskie.

Gwiazdy symbolizują jedenaście sołectw wchodzących w skład gminy: Czarnożyły, Emanuelina, Gromadzice, Kąty, Łagiewniki, Opojowice, Platoń, Raczyn, Staw, Stawek, Wydrzyn. Większa z gwiazd oznacza wieś gminną - Czarnożyły.

Herb Gminy Czarnożyły został przyjęty Uchwałą Rady Gminy Czarnożyły z dnia 30.06.2005 r. Jest on wizytówką oraz symbolem jednoczącym społeczność gminną.